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美國克萊蒙特學(xué)院Kiana Aran課題組--石墨烯場效應(yīng)晶體管固定Cas9鑒別未擴增基因組DNA的單點突變
簡單快速地檢測具有單核苷酸特異性靶基因的方法,可能會為實驗室以外的領(lǐng)域提供遺傳學(xué)研究和診斷方法。本文最近報道了一種用于電子檢測未擴增目標(biāo)基因的生物傳感器,該傳感器使用液體門控石墨烯場效應(yīng)晶體管,采用錨定在石墨烯單層上的RNA引導(dǎo)催化失活CRISPR關(guān)聯(lián)蛋白9 (Cas9)。在這里,使用來自未經(jīng)擴增的患者基因組樣本,并通過測量多種類型的電響應(yīng),該生物傳感器可以在一小時之內(nèi)區(qū)分出一個核苷酸的野生型和純合突變等位基因。同時,使用引導(dǎo)RNA-Cas9同源復(fù)合物的生物傳感器,針對來自鐮狀細(xì)胞病患者的純合子和雜合子DNA樣本,區(qū)分了原間隔-鄰近基序中的基因,并且該生物傳感器也可以用于快速篩選引導(dǎo)RNA-Cas9復(fù)合物,最大限度地提高了基因靶向效率。
 

Fig. 1 借助CRISPR技術(shù)的gFET,可無擴增地檢測單核苷酸突變。
 

Fig. 2 SNP-Chip可以區(qū)分不同的擴增子DNA樣本,其差異在于gRNA靶位點上的單個核苷酸。
 

Fig. 3 基于dCas9和Cas9的SNP芯片,從基因組DNA樣品中檢測與SCD相關(guān)的SNP。
 

Fig. 4 SNP芯片可以區(qū)分有無SOD1 SNP的樣品。
 

Fig. 5 MgaCas9 SNP芯片構(gòu)建體評估gRNA活性和雜合性。
 
       相關(guān)研究成果于2021年由美國克萊蒙特學(xué)院Kiana Aran課題組,發(fā)表在Nature Biomedical Engineering(https://doi.org/10.1038/s41551-021-00706-z)上。原文:Discrimination of single-point mutations in unamplified genomic DNA via Cas9 immobilized on a graphene field-effect transistor。

轉(zhuǎn)自《石墨烯雜志》公眾號

 
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